臨床検査技師国家試験

【過去問解説】Km値が2mMのときVmaxの98%を得る基質濃度は?ミカエリス・メンテン式で計算

第66回 臨床検査技師国試 生化学(酵素) 過去問-7

臨床検査技師国家試験では、ミカエリス定数 Km や最大反応速度 Vmax など、酵素反応速度論に関する問題が毎年のように出題されます。

とくに Km は基本事項として重要ですが、定義を知っているだけでは、本番の問題に対応するにはやや心もとない印象です。

実際の試験では、

  • Km の値から基質濃度を求める計算問題
  • Km と酵素‐基質の親和性の関係を問う問題

といった形で、もう一段踏み込んだ理解を求められることが少なくありません。

つまり、「用語として知っている」状態から、「使える知識」にしておくことが必要になります。

そこで今回は、過去の国家試験問題をもとに、ミカエリス・メンテン式の考え方と具体的な解き方、さらに試験本番で役立つ概算のコツや選択肢の見分け方について解説していきます。

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問題

出典:第66回 臨床検査技師国家試験(2020年実施)午後 問題29

ある酵素のKm値が2mMであるとき、最大反応速度の98%を得るための基質終濃度に最も近いのはどれか。

ただし、Michaelis-Mentenの式

v = Vmax × [S] / (Km + [S])

が適用される。

  1. 25
  2. 50
  3. 100
  4. 200
  5. 400

正答

正答は、

③ 100

です。

計算すると、最大反応速度Vmaxの98%を得るための基質濃度は、

[S] = 98mM

となります。

したがって、選択肢の中で98mMに最も近い、③ 100が正答になります。

選択肢には単位が書かれていませんが、問題文でKmがmMで与えられているため、求める基質濃度もmMとして考えます。

この問題で見られていること

この問題では、主に次の3点が問われています。

  • Kmが、Vmaxの50%を与える基質濃度であること
  • Vmaxの98%に対応する基質濃度を、ミカエリス・メンテン式から求めること
  • 計算結果に最も近い選択肢を選ぶこと

国家試験では、式を覚えているだけでなく、選択肢を見て妥当な値を選べるかも重要になります。

ミカエリス定数Kmとは

ミカエリス定数Kmは、反応速度が最大反応速度Vmaxの半分になるときの基質濃度です。

つまり、

v = 1/2 Vmax

となるときの基質濃度がKmです。

今回の問題では、

Km = 2mM

と与えられています。

したがって、基質濃度が2mMのとき、反応速度は理論上、最大反応速度Vmaxの50%になります。

ここで間違えやすいのは、Kmを「反応速度」と考えてしまうことです。

Kmは速度ではなく、基質濃度を表す値です。

Kmで覚えておきたいこと

Kmについて、国家試験で特に重要なのは次の3点です。

  • Kmは、Vmaxの1/2を与える基質濃度である
  • Kmが小さいほど、酵素と基質の親和性は高い
  • Kmが大きいほど、酵素と基質の親和性は低い

特に重要なのは、Kmが小さいほど基質親和性が高いという関係です。

Kmが小さいということは、少ない基質濃度でも反応速度がVmaxの半分に達するということです。

つまり、その酵素は基質と結合しやすいと考えます。

反対に、Kmが大きい場合は、反応速度をVmaxの半分まで上げるために多くの基質が必要です。

そのため、Kmが大きいほど基質親和性は低いと考えます。

国家試験レベルでは、Kmが小さいほど基質親和性が高いと覚えて問題ありません。

ただし、厳密にはKmは複数の反応速度定数を含む値であり、単純な解離定数そのものではありません。

ミカエリス・メンテン式

酵素反応速度は、次のミカエリス・メンテン式で表されます。

v = Vmax × [S] / (Km + [S])

ここで、各記号は次の意味です。

  • v:反応速度
  • Vmax:最大反応速度
  • [S]:基質濃度
  • Km:ミカエリス定数

今回の問題では、「最大反応速度の98%を得る」とあるため、

v = 0.98Vmax

として計算します。

丁寧に計算する方法

ミカエリス・メンテン式は、

v = Vmax × [S] / (Km + [S])

です。

問題文より、

v = 0.98Vmax

Km = 2mM

なので、式に代入します。

0.98Vmax = Vmax × [S] / (2 + [S])

両辺をVmaxで割ると、

0.98 = [S] / (2 + [S])

となります。

両辺に、

2 + [S]

をかけます。

0.98(2 + [S]) = [S]

左辺を展開します。

1.96 + 0.98[S] = [S]

移項すると、

1.96 = [S] – 0.98[S]

1.96 = 0.02[S]

したがって、

[S] = 1.96 / 0.02

[S] = 98mM

となります。

選択肢の中で98mMに最も近いのは、

100

です。

したがって、正答は、

③100

です。

試験本番での速い解き方

試験中に毎回ここまで丁寧に式変形をするのは、少し時間がかかります。

このタイプの問題では、次の形を知っておくと便利です。

v / Vmax = [S] / (Km + [S])

この式を変形すると、

[S] = Km × v / (Vmax – v)

となります。

今回は、反応速度がVmaxの98%なので、

v = 0.98Vmax

と考えます。

このとき、

[S] = Km × 0.98 / 0.02

です。

0.98 / 0.02 = 49

なので、

[S] = Km × 49

となります。

今回のKmは2mMなので、

2 × 49 = 98mM

です。

選択肢では100が最も近くなります。

概算で解く方法

国家試験では、「最も近いもの」を選ぶ問題がよく出ます。

今回も、正確な答えは98mMですが、選択肢には98mMはありません。

そのため、

Vmaxの98%を得るには、基質濃度はKmの約50倍必要

と考えると、かなり速く解けます。

Kmは2mMなので、

2mM × 約50 = 約100mM

です。

したがって、選択肢では100を選びます。

類題に使える公式

このタイプの問題では、反応速度がVmaxの何%かを使って基質濃度を求めます。

反応速度をVmaxの割合で表し、

v / Vmax = x

とすると、

x = [S] / (Km + [S])

です。

これを変形すると、

[S] = Km × x / (1 – x)

となります。

たとえば、Vmaxの98%なら、

x = 0.98

なので、

[S] = Km × 0.98 / 0.02 = Km × 49

となります。

この形を知っておくと、Kmの値が変わっても同じ考え方で解けます。

Vmax到達率と必要な基質濃度の目安

ミカエリス・メンテン式では、Vmaxに近づくほど、必要な基質濃度は大きくなります。

目安として、次の関係を覚えておくと便利です。

反応速度 必要な基質濃度の目安
Vmaxの50% [S] = Km
Vmaxの90% [S] = 9Km
Vmaxの95% [S] = 19Km
Vmaxの98% [S] = 49Km
Vmaxの99% [S] = 99Km

今回の問題では、Vmaxの98%なので、

[S] = 49Km

です。

Km = 2mMなので、

[S] = 49 × 2 = 98mM

となります。

KmとVmaxの関係

KmとVmaxは、どちらも酵素反応速度論で重要な指標です。

ただし、それぞれ意味が異なります。

Kmは、反応速度がVmaxの半分になるときの基質濃度です。

一方、Vmaxは、その酵素反応が到達しうる最大反応速度です。

基質濃度を高くすると反応速度は上昇しますが、無限に上昇するわけではありません。

酵素が基質で飽和すると、それ以上基質を増やしても反応速度は大きく増加しなくなります。

このときの最大の反応速度がVmaxです。

反応速度と基質濃度の関係

ミカエリス・メンテン式では、基質濃度[S]が高くなるほど反応速度vは大きくなります。

ただし、基質濃度を増やせば反応速度が比例して増え続けるわけではありません。

基質濃度が低い範囲では、基質を増やすことで反応速度は大きく上昇します。

一方、基質濃度が十分に高くなると、酵素の活性部位がほぼ基質で占められるため、反応速度はVmaxに近づきます。

この状態では、さらに基質を増やしても反応速度はあまり上昇しません。

今回の問題でも、50mMではVmaxの約96%、100mMでは約98%、200mMでは約99%となります。

Vmaxに近づくほど、反応速度の上昇幅は小さくなります。

試験で問われやすいポイント

Kmに関する問題では、次の内容がよく問われます。

  • Kmの定義
  • Kmと基質親和性の関係
  • Vmaxの何%になるかの計算
  • 競合阻害でKmとVmaxがどう変化するか
  • 非競合阻害でKmとVmaxがどう変化するか
  • Lineweaver-Burkプロットとの関係

今回の問題では、主にKmの定義と、ミカエリス・メンテン式を用いた計算が問われています。

次に確認したい関連テーマ

Kmの計算問題が理解できたら、阻害様式によるKm・Vmaxの変化も確認しておくとよいです。

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関連テーマ:競合阻害と非競合阻害

Kmに関連して、競合阻害と非競合阻害も国家試験でよく出題されます。

競合阻害では、阻害薬が基質と同じ部位に結合しようとします。

そのため、基質が酵素に結合しにくくなり、見かけ上のKmは上昇します。

ただし、基質濃度を十分に高くすれば、阻害薬の影響をある程度打ち消すことができます。

そのため、競合阻害ではVmaxは変化しません。

競合阻害:Km上昇、Vmax不変

 

一方、非競合阻害では、阻害薬が酵素の基質結合部位とは別の部位に結合します。

その結果、酵素の働きが低下し、最大反応速度Vmaxが低下します。

基質結合そのものへの影響は競合阻害ほど直接的ではないため、Kmは基本的に変化しません。

非競合阻害:Km不変、Vmax低下

競合阻害と非競合阻害の違いは、Kmの学習とあわせて押さえておきたい内容です。

Kmの問題でよくあるひっかけ

KmはVmaxそのものではない

Kmは反応速度ではなく、基質濃度です。

Kmは「Vmaxの半分の反応速度を与える基質濃度」と覚えましょう。

Kmが大きいほど親和性が高いわけではない

Kmが大きいほど、多くの基質がないと反応速度が上がりません。

したがって、Kmが大きいほど親和性は低くなります。

基質濃度がKmと同じでもVmaxにはならない

基質濃度がKmと同じとき、反応速度はVmaxの50%です。

今回のようにVmaxの98%に近づけるには、Kmの何十倍もの基質濃度が必要になります。

Vmaxに近づくほど、反応速度は上がりにくくなる

基質濃度を増やすと反応速度は上昇しますが、Vmaxに近づくほど上昇幅は小さくなります。

50mMから100mMに増やすと約96%から約98%になりますが、100mMから200mMに増やしても約98%から約99%になる程度です。

「最も近いもの」を選ぶ問題では、過剰に大きい選択肢を選ばないように注意しましょう。

確認問題

同じ考え方で解ける確認問題です。

確認問題1

Kmが3mMの酵素で、Vmaxの90%を得るために必要な基質濃度はどれくらいか。

Vmaxの90%なので、

[S] = Km × 0.90 / 0.10

[S] = Km × 9

です。

Km = 3mMなので、

[S] = 3 × 9 = 27mM

となります。

確認問題2

Kmが4mMの酵素で、Vmaxの95%を得るために必要な基質濃度はどれくらいか。

Vmaxの95%では、

[S] = Km × 0.95 / 0.05

[S] = Km × 19

です。

Km = 4mMなので、

[S] = 4 × 19 = 76mM

となります。

Vmaxの何%かがわかれば、同じ考え方で基質濃度を求められます。

まとめ

今回の問題では、Km値が2mMの酵素について、Vmaxの98%を得るために必要な基質濃度を求めました。

押さえるべき点は次の通りです。

  • Kmは、Vmaxの50%を与える基質濃度である
  • ミカエリス・メンテン式は、v = Vmax × [S] / (Km + [S]) である
  • Vmaxの98%を得るには、基質濃度はKmの約49倍必要である
  • Km = 2mMなので、2 × 49 = 98mMとなる
  • 選択肢では100が最も近い

したがって、正答は、

③ 100

です。

Kmの問題では、定義だけでなく、ミカエリス・メンテン式を使って基質濃度を求められることも大切です。

あわせて、Kmと基質親和性の関係、競合阻害・非競合阻害におけるKmとVmaxの変化も確認しておきましょう。